Yamaha MT09 được thiết kế theo phong cách naked kết hợp cùng phong cách guile cổ điển. Sự xuất hiện của MT-09 đánh dấu nhiều hơn là một chương mới trong sự tiến hóa của Yamaha. Động cơ thiết kế của mới với 3 xi-lanh mẫu xe naked kết hợp với phong cách guile này cho chúng ta một cái nhìn mới về thương hiệu Yamaha vốn luôn nổi tiếng với thiết kế mạnh mẽ và hiện đại. Yamaha MT-09 sự hòa trộn hoàn hảo giữa khung hình Nakedbike và Guile cổ điển. Với thiết kế được xem là khá hiền lành trong bộ tứ phiên bản. Không chỉ dừng ở các trang bị tiêu chuẩn, trang bị thêm kính chắn gió Puig smoke. Trang bị tăng cường cho ghi-đông lái với cùm côn dầu Brembo RCS, kính gù CRG Arrow. Đem lại sự nhẹ nhàng cũng như tăng sứt hút dành cho bản độ đến từ ghi-đông Rizoma , ngoài ra tăng cường sự ổn định tay lái với trợ lực HyperPro RSC. Dàn chân xa xỉ bên cặp phanh kép Brembo đi kèm dây dầu Earl's. Yamaha MT-09 được phát triển để thể hiện bản chất của “triết học crossplane ‘của Yamaha được thiết kế để đảm bảo đáp ứng ga ngay lập tức cùng với mạnh thấp đến tầm trung mô-men xoắn. Khối động cơ 3 xi-lanh được thể hiện qua ống xả IXRace tạo hình khá hầm hố. Yamaha MT-09 được xem là đối thủ của Triumph Street Triple và MV Agusta Brutale.
